Valtion tutkimusrahoitusta voivat Sisä-Suomen yhteistyöalueella hakea Pirkanmaan, Etelä-Pohjanmaan ja Kanta-Hämeen hyvinvointialueet sekä sosiaali- ja terveysministeriön asetuksella (375/2022) säädetyt muut palveluntuottajat. Tutkijat ja tutkimusryhmät jättävät tutkimushanke-esityksensä omille organisaatioilleen.
Sosiaali- ja terveysministeriö maksaa rahoitusta neljäksi vuodeksi kerrallaan. Ministeriön päätös perustuu tutkimustoiminnan painoalueiden ja tavoitteiden toteutumiseen sekä tutkimuksen laatuun, määrään ja tuloksellisuuteen.
Tutkimusrahoitusta haetaan Tutkijan digiasiointi -järjestelmän kautta.